Lunar : Eternal Blue sur Mega CD est un jeu de rôle se déroulant 1000 années après le premier opus. Le joueur prend les commandes d'une équipe composée de trois combattants, le protagoniste principal Hiro, un chat volant nommé Ruby, et sa nouvelle amie Lucia. Tous trois partent à l'assaut du machiavélique "destructeur". Chaque combattant possède ses propres spécificités. Les victoires augmentent l'expérience et permettent une évolution pour apprendre des attaques inédites.