Comme yabossban1, contraintes principalement.
De plus, les studios se font surtout de l'argent via la vente de dvd/blu-ray, pas par la diffusion à la tv, donc ils ne savent pas forcément si ça va se vendre ou non, et donc limitent les risques.
Faut souvent voir les animes comme des publicités au support de base, pas comme des adaptations pures.
Parfois ils corrigent des choses justement sur les versions physique ou ajoutent des épisodes en OAV (donc non diffusés à la télé).
Il peut aussi y avoir des contraintes horaires, par rapport au créneaux de diffusion, ils peuvent donc être à même de censurer les choses ou les rendre plus simples à comprendre pour s'adapter à un public plus casual et/ou jeune.