Vraiment étrange ce bug...
Je suis sûr que ça doit venir du patch pour jouer avec la carte Intel. Tu avais ce bug avant d'avoir installé le patch ou après ?
Parce que pour ma part, avant l'installation de ce patch, le jeu se lançait quand même sans les messages avertissant du changement de configuration mais crashait pendant le chargement après le lancement d'une nouvelle partie avec comme message "Fallout 3 a cessé de fonctionner". Je suis ensuite tombé sur ce patch, j'ai placé les 2 fichiers du patch dans le dossier Fallout 3 sans trop y croire. j'exécute le launcher, message m'avertissant d'une nouvelle configuration des graphismes, play, je lance une nouvelle partie, ça marche nickel.
Là, si j'étais toi, je réinstallerais le jeu et le patch mais je n'ai plus trop de solutions concrètes à te proposer.