J'ai passé 1 mois en Indonésie, ce qui est loin d'être assez pour en faire le tour.
C'est un pays ou tout le monde peut y trouver son compte.
Tu peux traverser l'ile de Flores en scooter : ile top si tu aimes l'aventure, ca reste peu touristique. De beaux spots de plongées, des plages désertes, des contacts authentiques avec les locaux.
Lombok est un juste milieu entre confort et authenticité. Tu peux gravir le volcan Rinjani, somptueux. Tu as des plages sympa au sud (Kuta Lombok) et a l'ouest (Sengiggi) mais c'est déjà plus peuplé. Spots de surf très sympas, pour surfer débutant ou confirmé.
Enfin il y a Bali, perfo je n'ai pas aimé plus que ça, c'est très très touristique et les rapports avec les locaux s'en trouvent dénaturés. Si tu aimes aller en party Party ça pourrait te convenir, beaucoup d'Australiens surtout en ce moment. Mais imo Thaïlande>Bali...sauf durant la mousson.
Il y a également l'ile de Java, que je n'ai pas eu le temps d'explorer, mais a part Yogyakarta, Borobodur et le volcan de gaz bleu les retours que j'ai eu étaient moins sexys.
Pour sumbawa, Sumba et le Kalimantan ce sont des iles encore assez sauvage ou parcourir 50km peut prendre 4 a 5 heures vu l'état des routes.
Hygiène et bouffe OK pour les standards asiatiques, pas besoin de booker les hôtels à l'avance- sauf éventuellement sur Bali.
Bonnes vacances!