Si ça peut aider, j'ai solutionner mon problème en rajoutant quelques lignes dans le fichier swkotor.ini.
Pour mon cas, j'ai un écran qui supporte 144hz et une résolution en 1920x1080, j'ai donc rajouter ces lignes-ci :
[Display Options]
Width=1920
Height=1080
[Graphics Options]
RefreshRate=144
Height=1080
Width=1920
Je n'ai toujours pas la possibilité dans les options de modifier la résolution, mais le jeu se lance en plein écran avec la bonne résolution.
Attention à bien vérifier que cette ligne soit présente et sur 1 : "FullScreen=1" au niveau de Graphics Options