Je comprends très bien t'as question, mais il s'agit encore une fois de l'éclaircir (n'est-ce pas l'enseignement socratique par excellence ?).
Tu parles de déterminismes, c'est à dire la théorie selon laquelle tout serait régit par des causes à effet, et d'athéisme, c'est à dire la croyance en l'inexistence d'une transcendance quelconque.
Or, l'athéisme ne nie pas nécessairement l'existence de l'âme, en tant que principe spirituel qui peut se perdre dans la mort ou pas.
Tu voulais peut-être plutôt parler du matérialisme, théorie selon laquelle n'existerait réellement que la matière, et qu'ainsi tout serait régit par les lois de celles-ci (menant au déterminisme).
Or, rien n'empêche de penser le libre arbitre tout en admettant le fait que nous soyons conditionné(distinction conceptuelle très importante, cela désigne une influence faisant partie de notre existence même -psycho, historico-politi, maté). En effet, il est difficile de lire dans la matière la raison exacte de l'engendrement de la pensée etc. Mais celui-ci existe dans les faits, on peut donc admettre que notre cerveau a atteint un point permettant l'existence de la conscience et par-là même du libre-arbitre.