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Sujet : fold.it, logiciel/jeu de repliement de proteines

1
blue-tamere blue-tamere
MP
04 mars 2020 à 02:26:05

https://fold.it/portal/

C'est un jeu/logiciel ou l'on peut s'amuser a plier des proteines, et aussi en designer. Ils ont fait parler d'eux ces derniers jours parce qu'ils proposent maintenant d'essayer de trouver une proteine qui empecherait ce nouveau coronavirus d'etre efficace: https://www.geekwire.com/2020/university-washington-coronavirus-puzzle-game-aims-crowdsource-cure/

En gros: meme en connaissant la composition d'une proteine (via sa sequence ADN) c'est tres complique de devener sa structure spatiale bien que ca soit une propriete fondamentale du comportement de la proteine. On fait beaucoup d'approximations physiques, et des algorithmes essayent de trouver la configuration la plus probable (d'ailleurs on peut donner du temps de calcul de son propre PC a ces logiciels, cf https://foldingathome.org/ ). Sauf qu'il y a tellement de configurations possibles que meme avec des supercalculateurs on s'en sort pas trop. L'idee derriere fold.it c'est que, peut-etre, naturellement nous humains on pourrait dans certains aspects etre plus efficaces que les algorithmes actuels. Si c'est le cas et qu'on comprend comment, ca pourrait aider a ameliorer ces algorithmes. Et pour etudier ca ils nous donnent un "jeu" qui nous fait essayer de trouver la forme que prennent des proteines. Les donnees sont collectees et analysees ensuite: c'est developpe par des chercheurs dans un but de recherche scientifique.

L'article wikipedia est pas mal pour des infos generales: https://fr.wikipedia.org/wiki/Repliement_des_prot%C3%A9ines
Sur https://fold.it/portal/ y'a beaucoup de trucs interessants(faq, dans le blog y'a plein de details techniques cools aussi).

Une idee du gameplay, mais pour s'en rendre compte soi-meme on peut telecharger et essayer, 'est juste une centaine de mo: https://www.youtube.com/watch?v=lGYJyur4FUA

Message édité le 04 mars 2020 à 02:28:45 par blue-tamere
taupequatorze taupequatorze
MP
04 mars 2020 à 09:16:20

Il existe plein de jeux dont les données accumulées sont susceptibles de faire évoluer la science.

En voici un autre exemple
https://eyewire.org/explore

Il y en a plein d'autres.

godrik godrik
MP
04 mars 2020 à 17:10:57

En parlant de folding at home. Le projet SETI at home a annonce qu'ils allaient arreter leur calculs sur la plateforme de desktop computing. Et ils demandent aux gens de continuer a donner leur cycle CPU a d'autres projet. https://www.wired.com/story/setihome-is-over-but-the-search-for-alien-life-continues/

foundernoob foundernoob
MP
05 mars 2020 à 20:14:26

Je crois que c'est une bonne idée d'épingle, utiliser le jeu pour faire avancer les sciences est un concept vraiment génial et qui je pense a encore de l'avenir.

Ca m'a fait pensé au Project Discovery sur le jeu EVE online qui permet de découvrir au travers d'un mini-jeu des exoplanètes à partir de données de l'ESA, la recherche permet de gagner des points en jeu et des compétences tout en aidant la science.
https://www.eveonline.com/fr/discovery

C'est venu s’intégrer au jeu grâce à un projet Européen nommé GAPARS (Gamification of participatory science for training and education purposes) : https://cordis.europa.eu/project/id/732703/fr

Si l'auteur est motivé pour faire un titre de topic plus générique, je pourrais l'épingler à la place de celui là.
Pseudo supprimé
11 décembre 2021 à 18:14:56

Ouais je suis sur leur discord

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