Rien compris, t'as "4 disque dur" c'est à dire ?
Faut donner toute la config pour comprendre.
Sinon à ta place je débrancherais tous les disques du PC, et je mettrais juste Windows sur un SSD vierge (pas le même que l'actuel, même une merdouille 120 Go ça suffit), et je ferais des tests pour voir si le problème persiste 
T'en as pour 20 min à tout péter à faire ça 