Oui quand tu aura installé le nouveau windows tu peux simplement aller dans le gestionnaire de disque et démonter les disque en retirant la lettre du volume. Ca rendra le disque invisible sous windows.
Simple et efficace.
Maintenant si tu veux empêcher que des petits malins puisse remonter le volume sur une lettre et accéder aux données, il te faudra faire un compte différent du compte admin et qui n'aura pas les droits admin. Car sinon il n'y a aucune solution pérenne a ton cas car un compte admin aura toujours la possibilité de se rétablir les accès au disque via windows, à moins que tu ne chiffre les disques via bitlocker avec l'autre windows (il te faut windows pro pour chiffrer des disques autres que la partition windows avec bitlocker)