Oui et non, En fait tu dois avoir un TV qui ne lis pas tous les formats audio, le DTS notamment. Du coup pour palier à ce problème, Plex décode la partie audio (et même certainement la partie vidéo) au niveau du PC/NAS puis l'envoie sans compression (en PCM donc) jusqu'à TV qui lui se charge de le renvoyer via l'optique au HC. En gros cela permet de lire les fichiers avec des formats pourtant non compatible sur le TV. Après c'est possible que ton TV est aussi une option d'encodage à la volée en Dolby ou DTS pour palier ce soucis (en gros le TV va prendre le signal PCM pour le compresser, mais avec perte, en Doby ou DTS ce qui permettra de conserver le 5.1).
En revanche quand tu lis un fichiers depuis le DD de ta Freebox, cette fois c'est bien le TV qui décode et non Plex depuis le PC/NAS. Du coup dans ce cas, le TV est capable d’envoyer le signal Dolby ou DTS via l'optique si le signal de base est en Dolby ou DTS. En revanche si tu essaies de lire un fichiers avec un format audio non compatible (donc souvent le DTS mais aussi les DTS HD ou Dolby True HD) tu auras juste un message comme quoi l'audio n'est pas supporté.