Alors j'ai un problème similaire il n'y a pas longtemps.
J'ai un SSD en BOOT et un raid0 en DATA
La dernière fois que j'ai réinstallé Windows 10, j'ai bien sélectionné le SSD pour installer Windows 10 mais une fois sur le bureau, en allant voir dans le gestionnaire de disque, j'ai vu qu'il avait installé la partition de BOOT sur mon Raid0 et le reste des données sur sur mon SSD (Répertoire windows10 etc...)
Va voir dans gestion des disques mais c'est surement le même problème.