Strictement aucune diff de perf. La différence entre micro et ATX c'est juste que la CM est coupé en bas, donc y'a moins de port PCI quoi 
Donc dans ton cas, vu que c'est des CM de la même gamme t'a que le nombre de port PCI qui change, si tu prévois pas de mettre des cartes d'extensions + carte wifi + carte son, ca posera aucun problème 