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Liste des sujets

[NEURON] Comment utiliser NEURON dans Python ?

Charlidor
Charlidor
Niveau 4
14 décembre 2019 à 19:22:04

Salut ! :)

J'ai besoin de votre aide pour utilise le module NEURON (https://neuron.yale.edu/neuron/) via Python 3. Le GUI de NEURON fonctionne, tout est bien installé, mais quand je cherche à importer NEURON dans Python, cela m'affiche ce message d'erreur :

Traceback (most recent call last):
File "/Users/c/Desktop/import neuron.py", line 1, in <module>
import neuron
ModuleNotFoundError: No module named 'neuron'

Que dois-je faire ?

blackapplex
blackapplex
Niveau 10
14 décembre 2019 à 21:39:00

Il faut l'ajouter à ton pythonpath

godrik
godrik
Niveau 30
14 décembre 2019 à 22:36:54

et probablement c''est package par pip, donc pip3 install neuron

Charlidor
Charlidor
Niveau 4
15 décembre 2019 à 11:26:12

Okay, merci pour les pistes !

J'ai crée le pythonpath entre mon fichier .py jusqu'au fichier "python" du dossier NEURON 7.7 (/Applications/NEURON-7.7/nrn/lib/python) dans le script :

import sys
sys.path.insert(0, "/Applications/NEURON-7.7/nrn/lib/python")

import neuron ne lève plus d'erreurs. Le problème est que j'ai parfois des erreurs notamment quand je cherche à importer rxd (from neuron import h, rxd). Surement car je n'importe pas l'ensemble du package de NEURON et je pense que la piste de godrik va m'aider.

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