Hello,
normalement tu peux récupérer le contenu de FCKeditor à la soumission du formulaire.
Je m'explique:
- en principe tu as un attribut "name" sur la balise HTML qui fait office de FCKeditor
Exemple:
<textarea name="contenu" class="FCKeditor"></textarea>
- ton élement HTML en question doit être dans un formulaire, qui contient un attribut "method" et dans lequel est présent un input de type "submit" (cela peut aussi être un button de type submit)
exemple:
<form method="post">
<textarea name="contenu" class="FCKeditor"></textarea>
<input type="submit" name="mon_super_bouton" value="Valider">
</form>
Quand tu soumets le formulaire (c'est à dire quand tu remplis les champs et que tu cliques sur le bouton), PHP va automatiquement créer des entrées dans la super globale $_POST (parce que le formulaire à un attribut "method" valant "post").
Ces entrées dans $_POST seront accessible via l'attribut "name" correspondant.
Dans l'exemple ci dessus, tu auras donc dans le tableau $_POST: $_POST['contenu'] = "ce_que_tu_as_ecris" et $_POST['mon_super_bouton'] = "Valider".
En l'occurence, le contenu du FCKeditor sera ici dans $_POST['contenu'] 
"Pro" tip: c'est toujours intéressant de savoir ce que contiennent tes variables et, surtout, la structure de tes tableaux, donc n'hésites pas à écrire un var_dump($_POST); en début de fichier quand tu développes 