Pourquoi ne pas partir sur un petit framework comme Laravel ?
Ca sera plus facile à reprendre en main par qqn d'autre par la suite (maintenance facilité), la solution sera plus sûre, plus professionnelle etc.
Quitte à migrer les données mysql_ vers du PDO, autant migrer en utilisant un ORM et une conception avec des DAO...
Sinon étant donné qu'il s'agit d'une refonte totale du site, autant partir sur des solutions de 2017 avec un node/express en back-end par ex.