Tu peux lire du PDF (pas fait, mais je pense que la complexité dépendra du formatage du PDF), du Word (là, c'est dépendant de la bibliothèque et aussi du Word) et d'autres fichiers.
La grande question est : as-tu besoin des valeurs contenues, ou uniquement des fichiers ?
Si c'est le second, la proposition de guitarre est la piste à suivre : utiliser le chemin absolu ou le File lui-même (dépendra de sa taille).
Si c'est le premier, il va te falloir trouver une bibliothèque lisant tes ressources.