Je n'ai pas été dans ce cas, mais ai lu beaucoup dessus.
Il faut déjà que tu regardes ton contrat pour vérifier si celui-ci contient une clause d'exclusivité. Celle-ci t'empêche de travailler pour un autre employeur.
Si ton projet n'est pas rémunéré et ne te prends pas de temps... tu fais ce que tu veux, on s'en fout DU MOMENT QUE tu respectes bien le fait que cette activité n'ait pas d'incidence sur ton travail.
Dès que ça commence à être un peu sérieux, vois avec ton responsable en lui expliquant ce que tu fais et obtiens un accord écrit (et obligatoirement écrit) pour ton activité à-côté.
La présence de la clause d'exclusivité influera sur la discussion.
Idem, toujours faire attention à ce que ce n'ait pas d'impact sur ton travail, ça peut t'être reproché et avoir des conséquences.
En discuter avec ton responsable permet d'être clean par rapport à ton entreprise et son accord écrit te permet d'être dans ton droit au cas où ton entreprise décide d'être casse-couille.
Ensuite, les précautions d'usages : ne pas bosser dessus sur ton temps de travail (même inter-contrat sauf accord écrit "tu fais ce que tu veux"), ne pas utiliser le matériel professionnel (pour cause de souci de droits d'auteur), penser à sa vie personnelle (dormir, sortir, se changer les idées...) et s'épanouir.