Il me semble que Junon n'a pas réussi à entrer dans un corps humain car les humains ont trop evolue génétiquement.
Elle est dans ce qu'on appelle "le gris", c'est plus ou moins le monde informatique. En gros elle est devenue une entité informatique, et Desmond et Clay y sont également enfermés.
Comme elle ne peut pas venir dans le monde des humains par l'impossibilité de trouver un corps, elle veut que les humains viennent à elle. En gros elle veut enfermer tous les humains dans le gris avec la complicité des sages.
D'après ce que j'ai compris c'est ça, corrigez moi s'il y a des erreurs.