Pas d'influence sur la trame principale, mais certains actes déclenchent ou non des quêtes secondaires.
Par exemple le type a qui on donne un pistolet dans la tour déclenche une ou deux quêtes secondaires. Par la suite tu le retrouve dans les égouts pour rejoindre la ville si tu lui a donné un pistolet.
Ou les quêtes des jumeaux, si tu ne les fais pas dans le jeux principal, tu ne les retrouve peut être pas dans The Following.
Le seul choix qu'il y a c'est à la fin de The Following.