J'ai eu la même et j'ai du tout recommencer car impossible de continuer l'histoire et mes quêtes annexes étaient bloquées aussi. Genre je récupérais un coffre d'une quête, j'avais bien l'item mais la mission ne se terminait pas..
Du coup je l'ai fini cette fois et je faisais 4 sauvegarde differente au cas ou 
Je pense que le bug est assez connu et sera patché dans les semaines à venir, faut être patient ou faire comme moi et recommancer malheureusement..