que je sache de tout le 5 ce n'est pas mentionner qu'ils le sont juste Vergil qui appelle Dante "petit frère"
Bah si, V quand il raconte l'histoire de Dante et Vergil il parle du fait qu'ils sont jumeaux à un moment il dit bien "twin brothers".
Même si plusieurs fois ils parlent de petit frère et grand frère, ils évoquent bien le fait qu'ils sont jumeaux. Et faudrait relire les rapports de Nico, mais il me semble bien qu'on voit écrit aussi qu'ils sont jumeaux.
Et quant au fait qu'ils ne se ressemblent pas tant que ça, déjà si quand même, ils sont plutôt proches. Et il faut prendre en compte quelque chose de tout bête qui est réel pour le coup, on a tendance à ressembler aux personnes qu'on côtoie. A force d'imiter les expressions faciales de quelqu'un etc notre visage s'adapte un peu et peut se différencier. Vergil et Dante ayant vécu chacun de leur côté on peut dire que c'est assez normal qu'ils aient des différences.
Sans parler du fait que Vergil est passé par plusieurs phases de transformations/corruptions avant de redevenir ce qu'il est actuellement. Je peux comprendre que ça ait eu une influence sur son physique. 
C'est un peu tiré par les cheveux mais en soit il y a vraiment pas mal d'explications possibles.