ils utilisent tous les deux des arbres de Merkle comme structure de données sous-jacente fondamentale, donc est ce que git est une blockchain ?

Par rapport à une block chain crypto on va dire que la seule différence est qu'il n'y a pas de validateurs qui empèchent de réécrire le passé d'un historique git.

Techniquement similaire, mais je ne maitrise pas le sujet à 100%, git peut etre considéré comme une blockchain néanmoins ...

Non pas du tout.
GIT est simplement un système distribué asynchrone (pas d'update en live des nœuds de manière native). Pas de consensus, donc pas de notion de "trust".
Il y a simplement une signature de commits possible, mais n'a aucun sens (cf. Linus Torvalds "signing every commits is stupid").
Bref, c'est simplement un réseau distribué comme l'est la rivière par exemple.