C'est logique. Tu changes les icônes seulement.
C'est un peu comme si tu changeait l’emballage d'une boisson coca cola en origina. A l'intérieur de la bouteille, ça reste du coca. La boisson ne va pas changer d'elle même son contenu parce qu'elle porte une autre étiquette. Là c'est pareil. Le pack n'a aucun moyen de savoir qu'il doit aussi changer de texture du skin de l'armure si tu ne la remplace pas !
Va dans textures/models/armor et place-y les fichiers correspondants.
Par exemple, pour le fer : iron_layer_1.png et iron_layer_2.png