Moi de ce que j’ai compris de la fin, après je peux me tromper, c’est qu’on est contrôlé nous aussi comme les autres... a la fin on découvre cette zone mais cette zone est une maquette qu’on voit dans le jeu un peu avant... du coup j’ai l’impression que le petit garçon est aussi un pantin au final même si il il croit être libre 
Dans la base secrète il me semble que tu peux d’ailleurs te désactiver non ? 
Après ce genre de jeu laisse place à toute les spéculations possible