Fais une copie de ta save en lieu sur, histoire de ne pas avoir de mauvaises surprise, mais sinon, vu que c'est sauvegarder dans un dossier indépendant, y'a pas de problème.
Fais juste une désinstallation propre et une installation de meme et tu te retrouvera toujours avec tes save ( il est meme possible que, lors de la désinstallation, le Pc te demande si tu veux garder ou virer les save ^^ ).