Gon a onze ans, et son rêve est de devenir Hunter. Les Hunters sont des chasseurs d´élite, aussi bien aventuriers, archéologues, que justiciers. Son père, qu´il ne connaît pas directement, est l´un des plus grands Hunters de son temps. C´est aussi pour retrouver celui-ci que Gon veut devenir Hunter.
Cependant l´examen de Hunter, qui a lieu chaque année, est extrêmement difficile. On dit qu´un candidat sur 10 000 arrive sur le lieu des épreuves, et qu´un candidat tous les trois ans devient Hunter à sa première tentative. Au cours des examens, il n´est pas rare d´être blessé, voire tué par des monstres ou même d´autres concurrents...
Au cours de cet examen, Gon va rencontrer différents personnages, aussi bien amis qu´ennemis : Kurapica, dont le seul objectif est de venger sa famille assassinée ; Léolio, dont le but avoué est d´acquérir de l´argent mais qui en réalité rêve d´être médecin ; Kirua, 12 ans, fils d´une famille d´assassins, en rébellion contre ladite famille ; Hisoka, dont la grande passion est l´assassinat ; ainsi que beaucoup d´autres.
A noter que la force de Gon n´est pas que physique, son charisme, son intelligence, son sang-froid l´aident souvent à sortir des situations les plus périlleuses.