Alors ça m'a tout à fait l'air d'etre un problème venant de l'émulateur. Par contre je connais pas du tout les émulateurs N64 (je préfère les PSX, perso), mais essaie de voir dans les options "Graphismes" (ou équivalent) si tu peux changer quelques options, surtout liées aux backgrounds, ou encore le taux de rafraichissement de l'image (Hz), etc...
L'émulation, c'est hasardeux, donc va falloir faire quelques tests et mettre les mains dans le cambouis 