"Pourquoi ment-il a StrangeLove ?"
Pour préserver la couverture de The Boss. Comme l'a indiqué Afneu, The Boss a choisi de se sacrifier pour le bien de son pays et pour qu'il récupère l'Héritage des Philosophes. Snake respecte ce choix et décide donc de préserver ce mensonge.
"- Gene a-t-il menti sur ce fait ?
- S'il a dit la vérité qui à prévu ça ? Pourquoi ?"
- Non.
- Coldman. Tout MGS3 était le plan pour récupérer l'Héritage des Philosophes, et Peace Walker nous apprend que Coldman en était l'auteur.
"- Et donc si c'est bel et bien ça, BB qui s'est fait dire tout ça par GENE est donc au courant, par conséquent il s'agirait en plus de dire que The Boss n'a pas trahi mais a été trahi. Ma question "Pourquoi ment-il à StrangeLove ?" prend donc encore plus d'ampleur."
Réponse ci-dessus. 
Snake était déjà parfaitement au courant de toute l'histoire depuis MGS3, les seuls détails lui manquant étant le nom de Coldman et le fait que le plan soit entièrement de lui. Ce qui renforce l'impression que Portable OPS ne sert à rien du tout.
Il faut bien comprendre aussi que Portable OPS, c'est une espèce de vilain petit canard, un épisode bâtard qui n'a pas été réalisé par Kojima et qui gêne complètement ce dernier, qui a du coup tendance à essayer de le faire oublier. Résultat, personne ne sait si Portable OPS est canon ou s'il a gagné un aller simple dans le monde des jeux Metal Gear hors-série. On a bien 2-3 indices forts, mais rien de concluant ou de définitif, et donc on ne sait pas à l'heure actuelle s'il faut prendre en compte les événements de Portable OPS.
A partir de là, y'a grosso modo deux écoles de pensée : y'a les fanatiques, ceux qui boivent les paroles de Kojima sans aucun recul et qui disent amen à chaque décision, aussi absurde et illogique soit-elle, et y'a ceux qui réfléchissent un peu plus et qui pensent que malgré ses (nombreux) défauts, ce jeu ne devrait pas être oublié simplement parce que Kojima n'était pas aux commandes.