Tout commence à la fin des années 1990 lorsque l’intelligence artificielle fait son apparition dans la vie de tous les jours pour les hommes. Mais les progrès en ce domaine vont être très rapides, a tel point que l’IA va devenir une chose capable de penser comme l’être humain. Les machines, qui possèdent une IA, vont alors se rendrent compte qu’elles sont les esclaves de l’être humain et vont se rebeller… Va s’en suivre une guerre terrible entre humains et machines qui va vite tourner à l’avantage des rebelles. Les humains, dans une dernière tentative, créent une barrière électrique au niveau des nuages qui empêche toute machine de la traverser, et assombrissent les nuages pour que la lumière du jour ne puisse plus alimenter les machines en énergie. Les humains, eux aussi contraints par cette action à cause du froid qui règne alors sur la Terre, décident de se réfugier en profondeur, où il fait plus chaud, et ou les machines ne les trouveront jamais. Les machines, privés de leur source d’énergie, vont alors en trouver une autre, les hommes. En effet, la chaleur que produit l’homme peut être modifiée en énergie. Ainsi, les machines vont capturer des millions d’hommes et les « cultiver », dans des cocons pour tirer leur chaleur. Seuls quelques hommes arrivent à s’échapper et à se réfugier dans leur nouvelle ville sous terre : Zion. Mais les hommes ne se laissent pas cultiver sans rien dire et les machines doivent trouver un moyen pour qu’ils se laissent faire. C’est pourquoi ils laissent le soin à deux programmes informatiques très puissants, nommés l’architecte et l’oracle le soin de créer une matrice, c’est à dire un monde virtuel qui paraîtrait tellement réel que les humains croiraient à la réalité et se laisseraient faire. L’architecte est nommé ainsi car c’est lui qui va crée la matrice, et il s’occupera de la partie virtuelle de la matrice. L’oracle doit son nom a son pouvoir de voir dans un futur très proche(quelques secondes) mais aussi de savoir quelles décisions chaque personne doit prendre sans savoir quelles conséquences elles auront. Elle est chargée de s’occuper du monde réel. La 1ère matrice créée et implantée sur les humains cultivés sera un échec. En effet, l’architecte va former un monde virtuel parfait, où chaque personne aura le bonheur, la richesse…Mais les hommes ne vont pas adhérer à ce programme car il ne ressemble pas a leur habitude mais aussi car le bonheur doit être une quête pour l’homme. L’architecte va donc créer une deuxième matrice, celle ci essayant d’être la plus proche possible du monde que connaissaient les hommes dans les années 90. Celle ci va être un succès, les hommes vont adhérer et vont pouvoir être cultivés tranquillement. Cependant, des problèmes persistent. Il arrive que certains hommes n’adhèrent pas à la matrice, celle ci n’étant pas parfaite. Ces hommes arrivent à se libérer, libère petit à petit les autres prisonniers, et se réfugient à Zion, et le nombre d’hommes cultivés baisse de plus en plus…d’autant que les machines ne trouvent toujours pas la localisation de Zion. L’architecte va donc trouver une première parade. Il va créer des agents, programmes inhérents à la matrice qui ont le sombre travail de tuer toute personne dans la matrice qui est susceptible de se réveiller, pour éviter toute fuite d’humains. Les agents vont ainsi ralentir ce nombre mais ne vont pas éviter l’arrêt total des « anomalies », c’est à dire des personnes résistant au pouvoir de la matrice. L’architecte va donc trouver une autre solution. Grâce aux pouvoirs de la matrice, il va donner à un être humain cultivé des pouvoirs surpuissants à l’intérieur de la matrice, l’élu. Ainsi, celui ci va se libérer, libérer ses frères cultivés, pour peu à peu former un groupe important qui se dirigera vers Zion. A ce moment la, les machines pourront situer la ville grâce aux mouvements de population importants, où encore grâce à un traître qui pourra leur indiquer l’endroit de la ville sous la torture… Alors, les machines pourront attaquer la ville et détruire Zion, le problème étant réglé. Cependant, l’architecte, obsédé par l’équilibre des équations ne se satisfait pas de cette solution. En effet, le problème reviendra car des anomalies réapparaîtront dans la matrice dans le futur. Souhaitant améliorer sa matrice, il trouve une autre solution : lorsque les machines attaquent Zion, il parlera à l’élu, et lui laissera deux choix : soit il choisit la destruction de Zion et l ‘architecte lui permettra de libérer le plus de personnes possibles des cultures pour ainsi recréer une autre Zion autre part et ainsi sauver l ‘humanité, soit se battre pour sauver Zion, mais sachant que les machines sont plus fortes, il aura toutes les chances de perdre. S’il choisit la 2ème solution, cela aura une conséquence bien plus grave : la matrice sera détruite avec tous les hommes cultivés à l’intérieur et l’humanité n ‘existera plus… On remarque donc que l’architecte se démarque des machines en prenant ses propres choix. En effet, si l’élu venait à choisir la 2ème solution, la matrice serait détruite et ainsi les machines qui n’auraient plus l’énergie humaine… Le but de l’architecte est simple. Il est persuadé que l’élu choisira le 1er choix, voulant sauver l ‘humanité. Ainsi, Zion sera détruite mais reconstruite par d’autres hommes et le processus recommencera encore et encore… A chaque fois et à chaque nouvel élu, l’architecte pourra observer les caractéristiques, à travers l’élu, des personnes qui ne se soumettent par à la matrice. A chaque nouvel élu, il pourra « recharger » la matrice ( reload en anglais d’où le titre de matrix 2) c’est à dire la reformater et en créer une autre qui aura moins d’anomalies. Peu à peu, la matrice n’aura plus aucune anomalie et l’équation sera équilibrée. Lors d ‘un rechargement, seul les etres inhérents au système restent, c’est a dire l’architecte, l’oracle, les anciens élus…C’est pour cela que Néo les voit en or, alors que le reste de la matrix est en vert.
Lorsque Matrix commence, on en est à la 6ème version de la matrice sans compter la 1ère qui fut un échec. A chaque fois que l’élu a libéré quelques hommes pour refonder Zion, celui ci est mort, tué par les machines car s’étant sacrifié pour libérer ses frères. Cependant, lorsqu’un élu meurt, son corps n’existe plus mais son âme retourne dans la matrice. Cependant, trois éléments déterminant vont changer le cours de l’histoire. Le 1er est que l ‘oracle ne peut plus supporter les destructions successives de Zion avec ses millions de morts. En effet, comme toute chose doit être équilibrée dans la matrice, l’oracle, veut aider les humains par opposition à l’architecte qui n’a aucun remord à les tuer. Ainsi, elle va aider les humains, et pousser inconsciemment Néo, le 6ème élu, à choisir le 2ème choix face à l’architecte. Le 2ème élément qui va tout changer est l’amour entre Trinity et Néo. En effet, face au choix avec l’architecte, il aura plus tendance à choisir le 2ème choix qui lui permettra de vivre un petit laps de temps avec Trinity avant de mourir que le 1er qui tuera instantanément Trinity ce qu’il ne pourra pas supporter. Et l’amour n’est pas quelque chose incluse dans la matrice. Enfin le 3ème élément est que cet élu la, Néo, est plus puissant que les autres. Cependant, ceci a des conséquences encore plus terribles. En effet, comme toute équation doit être équilibrée, la puissance de Néo qui se bat pour la paix va engendrer dans la matrice un autre être doué d’une puissance similaire, mais lui ayant pour but le mal. Celui ci sera l’agent que Néo tuera dans Matrix 1, Smith. En le tuant, il le libère de la matrice et lui donne la résultante de l’équation, c’est à dire une force égale à Néo. Comme tous les autres élus, Néo va suivre un parcours similaire jusqu’à son arrivée face à l’architecte. Poussé par les points abordés plus tôt, il va pour la première fois choisir la 2ème option. Il est donc renvoyé dans le monde réel et l’humanité n’a plus que quelques heures à vivre… Cependant, dès son arrivé, il fait un miracle. Face a des sentinelles, il arrive à les détruire rien qu’en y pensant, chose qu’il ne pouvait avant faire que dans la matrice. Ceci est du au fait que son esprit est troublé par les allers et venus entre le monde réel et imaginaire. S’il arrive à faire croire à son esprit qu’il est dans le monde imaginaire, les pouvoirs sont toujours présents. Cependant, ceci marche très mal car l’esprit se rend vite compte de la supercherie. Il est pourtant possible qu’avec un entraînement ces pouvoirs soient plus efficaces. Cet exercice est malgré tout très douloureux pour lui et il tombe dans le coma. Il se retrouve alors dans un monde entre la matrice et le réel, dans une station de train qui symbolise l’endroit où est choisit quelles données peuvent rentrer ou non ou sortir de la matrice. Libéré de cet endroit, il décide alors d’aller dans la ville des machines. Car dans le même temps, Smith, qui réussit à se dupliquer grâce aux pouvoirs qu’il a tiré de la pseudo mort de Néo dans Matrix 1, efface toutes les personnes virtuelles et réinscrit son programme dessus, comme un virus, pour qu’il n’existe que des Smith. Il essaye ainsi faire buguer la matrice pour la détruire, son but étant la destruction totale de la matrice et du monde réel. Mais aussi il duplique l’oracle et Séraphin pour devenir au moins aussi puissant que Néo. Mais Smith n’en reste pas la. Il a réussit aussi à se dupliquer en un humain avant que celui ci ne revienne dans le monde réel. Ainsi, il est dans le corps d’un humain mais il garde la possession de son esprit. Il se glisse dans logos de Néo et Trinity et essaye de les tuer. Néo le tue mais devient aveugle. Arrivés devant la ville, les défenses des machines attaquent le logos. Néo arrive à tuer des sentinelles grâce à son pouvoir mais elles sont trop nombreuses. Trinity décide de faire monter le navire vers le ciel pour passer au-dessus des sentinelles. Ils atteignent les nuages et font une trouée à l´aide des répulseurs du logos. Les nuages s´écartent laissant passer la lumière du soleil qui fond sur le paysage éclairant le sol et les machines qui se mettent alors à disjoncter et mourir partout à cause de la barrière électrique. Malheureusement la barrière a le même effet sur les répulseurs du " Logos" qui se retrouve sans propulsion, et chute vers la surface. Trinity dans un essai désespéré arrive à redémarrer les moteurs du Logos mais trop tard pour éviter de s´écraser contre une tour de la cité des machines. Néo retrouve ses esprits et découvre Trinity empalée à ses cotés. Elle demande à Néo d´y aller et de la laisser mourir. Néo dehors se retrouve sur une plate-forme qui surplombe la cité des machines. Les machines s´écartent soudain alors que des éclairs apparaissent en contrebas et se rapprochent. L´esprit de la cité des machines se révèle être une énorme sphère au centre de laquelle toutes les petites machines qui entouraient Néo se mettent à tourbillonner et forment un visage. Néo leur explique qu’ils ont perdu le contrôle de Smith et que s’il ne fait rien, il détruira tout le monde. Il dit qu’il peut le détruire si les machines acceptent de faire la paix avec les hommes. Les machines acceptent car Néo est leur seule chance. Néo se laisse alors brancher pour accéder à la Matrice. L´affrontement avec Smith peut commencer…
Le combat semble interminable car les deux sont de force égal. Cependant Néo semble abandonner. Le combat se termine à un moment ou Smith en tant qu´Oracle revoit la scène qu´il est en train de vivre et va vivre tout de suite après. -"Que disons nous ? Tout ce qui a un début a une fin..." Il s´approche de Néo et fond sur lui littéralement pour fusionner comme il fusionna avec l´oracle. Les machines, comprenant ce qui se passent, débranchent Néo pour le tuer. Smith qui était devenu Néo meurt ainsi tout comme Néo. L´agent Smith est détruit, l´oracle récupéré et l´esprit des machines comprenant se qui s´est produit amène la dépouille de Néo on ne sait ou… La paix entre les machines et les hommes est annoncé, c’est l’explosion de joie à Zion, qui était en train de combattre et de perdre face aux machines.
La matrice aurait donc du être détruit comme l’avait annoncé l’architecte. Mais celui ci ne voulant pas qu’elle soit détruite l’a « rechargée », évitant la destruction de la matrice. La nouvelle matrice a deux éléments en plus que la précédente : le soleil y est plus présent, symbole de la paix retrouvée, et elle incorpore maintenant le principe d’amour…
Plus tard, dans la nouvelle matrice, nous voyons l´oracle dans un parc assise sur un banc, en conversation avec l´architecte. Pour la 1ère fois, c’est l’oracle qui a « battu » l’architecte. L’architecte doute que la paix durera au contraire de l’oracle qui en est sûr. Les hommes ont maintenant enlevés la barrière électrique et éclaircis les nuages pour retrouver le soleil. Et enfin, tous les humains prisonniers de la matrice qui le souhaitent pourront en sortir. Tout est bien qui finit bien…
