C´est pas grave si certaines villes ont un solde négatif du moment que les autres te rapportent de l´argent ( elles participent en effet toutes aux dépenses à engager).
Ce que tu peux faire, déjà, c´est réduire le nombre de tes armées ( les Romains sont puissants, tu peux souvent gagner même en infériorité numérique) car elles " pèsent" sur ton budget semestriel. Essaie ensuite de conquérir de nouveaux territoires et de développer leur population ( mais impact à long-terme seulement). Tu peux par contre mettre tes villes initiales en " politique financière" pour maximiser leurs revenus.
Tout ceci devrait te permettre de remonter doucement la pente ! 