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Le FC Rouennais créé le 11 juillet 1899 est devenu par la suite le FC Rouen. En août 1995, le FCR devient FC Grand Rouen suite à un dépôt de bilan. Deux ans plus tard ( décembre 1997), l´Olympique du Grand Rouen voit le jour après un nouveau dépôt de bilan. Pour aboutir au Football Club de Rouen 1899 en juillet 2000 avec l´arrivée d´un nouveau président en la personne de René Bertin.
L´un des plus anciens clubs français compte à son palmarès 16 saisons en D1, 35 en D2 et une finale de Coupe de France en 1925. En mai 2003, le FC Rouen 1899 accède au Championnat de France de Ligue 2.