Lorsque vous aurez détruit le SA-X, franchissez la porte située tout en haut, sur la gauche, pour rejoindre la salle de contrôle ( O-3). Une fois que vous aurez activé la machine, vous disposerez de trois minutes pour revenir au vaisseau et vous enfuir. Lorsque vous atteindrez l´emplacement de votre vaisseau ( T-16), vous verrez un gigantesque ennemi. Restez sans bouger le long du mur de gauche ; il finira par vous attaquer en ne vous laissant qu´un seul point de vie. SA-X apparaîtra alors et tirera sur l´ennemi à l´aide d´un rayon de glace, mais mourra en tentant de l´éliminer. Récupérez les parasites X restants et vous retrouverez toute votre énergie. Il ne vous restera qu´à triompher de l´ennemi final !