Je vais essayer de te répondre, mais je suis pas du tout une boss en la matière... ^^
Pour les étendues d´eau, j´ai jamais eu à en traverser, mais je pense que tu peux utiliser un port.
Et pour les villes côte à côte, ça te permet par exemple de raccorder une ville industrielle à une ville résidentielle, pour limiter la pollution, ou de partager tes ressources avec tes voisins. (par exemple, tu peux signer un accord selon lequel tu vends de l´énergie à une autre ville, etc...)