Ajouts exclusifs à la version Game Cube:
-Huit nouvelles missions non intégrées à l´intrigue.
-Missions spéciales obtenues grâce au lien Game Cube/GBA.
-D´autres fonctions utilisant cette liaison et ne nécessitant pas la version GBA de Splinter Cell.
-Contrôles simplifiés
-Nouveau gadget: bombe adhérante
Ajouts exclusifs à la version PlayStation 2:
-Une nouvelle mission intégrée à l´intrigue nommée «The Powerplant»
-Nouveau gadget: jumelles.
Ajouts similaires aux deux versions:
-Nouveau système d´exploitation des ombres et de lumières.
-Nouveaux effets graphiques.
-Légère modification des niveaux.
-Deux nouveaux niveaux de difficulté.
-Nouvel icône d´alarme à l´écran.
-Nouvelle introduction du jeu ainsi que le rajout de 30 min. de cinématiques.