Dixième ennemi : Metroid Prime
Pour vaincre cet ennemi, vous devez le rencontrer dans deux combats différents :
Dans le premier combat, tirez sur ses yeux. Vous DEVEZ utiliser un rayon de la couleur appropriée ! ( Quand il est rouge, utilisez le Rayon de Plasma, quand il est blanc, utilisez le Rayon de Glace, etc.)
Plus vous le blessez, plus le Metroid Prime s´éloigne, alors continuez d´attaquer de la même manière. À un certain moment, un rayon vert vous poussera vers la créature - profitez-en pour tirer sans arrêt, car vous réduirez son énergie de manière considérable. Le Metroid Prime utilisera aussi un Rayon de Glace contre vous - sautez par dessus pour éviter d´être touché ( vous devrez sauter deux fois de suite). Quand il change de côté, passez en mode Boule Morphing et réfugiez-vous dans les trous qu´il a fait dans le sol. Après plusieurs assauts, il sera détruit - mais ce n´est que la première manche !
Dans le second combat, vous verrez le véritable Metroid Prime ! Il se déplace en faisant des zig-zag sur l´écran.
Évitez d´être touché en bougeant sans arrêt. Le seul moyen de prendre le dessus sur l´ennemi consiste à profiter des petites nappes de Phazon qui apparaissent dans la zone. Si vous vous tenez dans l´une d´elles, votre arme sera dotée d´une aptitude très spéciale : le Rayon de Phazon. Utilisez une Bombe de Puissance pour vous débarrasser des petits Métroïdes et utilisez le Rayon de Phazon sur le Metroid Prime. Vous devrez vous servir du Viseur Radioscopique pour localiser les nappes de Phazon, et du Viseur Infrarouge pour localiser le Metroid Prime dans le noir.