Quand vous avez obtenu le Diffuseur d´Ondes, retournez à l´Arboretum. De là, prenez la porte qui mène au Hall de rassemblement ( empruntez la porte du niveau supérieur, tirez sur les champignons toxiques, puis sautez de plate-forme en plate-forme). Suivez l´unique chemin jusqu´à parvenir à une marche où vous verrez des yeux tirant des rayons verts. Regardez sous la marche et vous pourrez ouvrir un trou à l´aide d´une bombe Boule Morphing. Suivez ce tunnel, et explosez les murs quand vous en rencontrez.
Au bout du tunnel, vous devez aller dans la Chaufferie en mode Boule Morphing. Pour y aller, vous devez tout d´abord activer des plates-formes pour atteindre la porte et l´ouvrir. Cette porte vous mènera à un rail magnétique. Il y a une créature qui vous avalera si vous vous approchez trop en mode Boule Morphing. Mais si elle le fait, explosez-la avec des bombes. Après ça, continuez, et vous devrez activer les Connecteurs Boule Morphing à l´aide de bombes. Quand vous en tirez une, passez vite au suivant.
Lorsque les trois sont activés, montez sur les plates-formes qui se sont élevées au-dessus de la porte qui s´est ouverte.
À l´intérieur, vous arriverez à un rail magnétique. Montez dessus avec la Boule Araignée, et vous pourrez ainsi accéder à la Chaufferie. Passez dans les tunnels, en vous servant de bombes pour recouvrir les trous laissés par les blocs disparus, de manière à ne pas tomber. Une fois dehors, vous arriverez dans une zone où se trouve un tuyau où vous pourrez tourner et atteindre de grandes hauteurs pour arriver sur les rails magnétiques. Là, vous pouvez utiliser des bombes pour activer des Connecteurs Boule Morphing afin d´obtenir plus de missiles. Si vous restez sur le premier niveau, vous verrez une porte qui s´ouvre à l´aide de missiles - allez-y. Maintenant, vous êtes dans le Hall des Anciens, où l´on trouve des Fantômes Chozo dont vous pouvez vous débarrasser facilement en chargeant un Rayon de puissance. Lorsque vous vous en êtes débarrassé, roulez en mode Boule Morphing dans les mains de la statue pour activer un Connecteur Boule Morphing.
Il reste 3 Connecteurs Boule Morphing de couleurs différentes. Allez vers eux et activez le premier ( tirez une première fois dessus avec une arme de la même couleur). Ensuite, sautez à nouveau sur la statue en mode Boule Morphing et vous pourrez grimper jusqu´à une porte que vous ne pouviez pas atteindre auparavant ( si vous supprimez la barrière devant la porte, vous pouvez l´atteindre quand vous voulez, sans avoir à utiliser la statue). Avancez jusqu´à parvenir à une piscine. Utilisez le mode Boule Morphing pour placer une bombe au fond de la piscine afin de la vider, puis vous pourrez l´utiliser pour atteindre les niveaux supérieurs ( en tournant et en accélérant).
Il y a des Crapauds de pierre à cet endroit. Laissez-les vous avaler, et utilisez des Bombes pour vous en débarrasser. Dans une pièce située au-dessus, vous trouverez facilement le Rayon de Glace.