Tu as bien résumé les différences principales.
Pour pinailler disons que l'agrégé bosse 15h par semaine quand le certifié(capes)bosse 18h par semaine.
Au delà de ça avec le capes tu commenceras automatiquement en collège et ta carrière sera forcément en collège/lycée. L'agrégation de donne plus de chances d'enseigner directement en lycée(même si soyons franc ça reste peu fréquent) et t'ouvres ensuite la possibilité d'enseigner en bts/dut/prépa/licence en théorie. Enfin l'agrégation sert pour certains étudiants, normaliens notamment, à se construire un "cv" solide pour être recruté comme enseignant dans le supérieur après leur doctorat.
Comme tu l'as dit l'agrégation est beaucoup plus difficile, et si tu veux la passer vérifie que tu as bien un cours/option en langue ancienne, latin ou grec.
Good luck pour ta L1, je viens de finir la mienne :p