Il n´y a pas vraiment de différence : le cel shading est de la 3D.
Sauf erreur de ma part ( quelqu´un saura me corriger si je me plante ) :
La différence se situe dans le détourage ( les formes sont bien distinctes les unes des autres grâce à des traits bien plus épais que d´habitude ) et dans les textures appliquées. Ces textures donnent une impression de 2D posée sur de la 3D.