ça dépend du type de pile et de chargeur...
Si le chargeur est "intelligent" (i.e. il se déconnecte lorsque les piles sont chargés) et s'il peut déconnecter indépendamment les différentes pile alors oui pour la charge. Sinon ça dépend de la résistance des batteries (à une surcharge).
Pour l'utilisation, a priori c'est pas terrible (encore une fois ça dépend un peu du matériel) mais ce n'est pas trop gênant non plus si tu n'as pas le choix.