Cette flore est stable c'est à dire qu'elle se compense (elle prévient par son équilibre la prolifération de bactéries commensales potentiellement dangereuses comme le Clostridium Difficile) pour éviter le développement de bactéries commensales potentiellement dangereuses.
Ceci dit si tu es immunodéprimé (VIH, maladie auto-immune, traitement immunosupresseur surdosé, âge avancé...) ces bactéries commensales peuvent devenir des germes opportunistes et créer des infections rares (infections opportunistes justement) car avec un bon système immunitaire il est quasiment impossible de développer ce type d'infections.
En tout cas ce n'est pas juste une question de "dose pathogène" mais une interactions de facteurs dont le système immunitaire, les agents infectieux exogènes et la flore polymicrobienne commensale elle même.