Mode heroïque: "En effet, non seulement les ennemis frapperont deux fois plus fort qu'à l'origine, mais il ne sera plus possible de trouver des cœurs pour régénérer sa vie. Il sera donc nécessaire de porter le Médaillon du Cœur, ou de faire extrêmement attention... Mais ce n'est pas tout. Afin de redonner un certain intérêt au jeu, il sera possible de passer les cinématiques, et certains dialogues seront modifiés, dévoilant certains secrets. L'épée de Link change également puisque la Master Sword ne nécessite plus d'être chargée pour lancer son coup spécial Skyward Strike.
En bonus, finir le jeu débloque également un mode Boss Rush, permettant d'enchainer les douze boss du jeu."