Le jeu contiendra plus de 14 personnages dont certains seront déjà connus de la série Clash of Ninja mais dont une partie seront de nouveaux personnages jamais vu dans la série.[4]. Il sera composé également de neuf modes différents (mode histoire, score attack, time attack, survival, Versus 2 joueurs, Score Attack 2 joueurs, Survival 2 joueurs et un mode multijoueur de 1 à 4 joueurs. Les niveaux seront composés de deux zones distincts, c´est-à-dire que le combat débutera sur une zone et pourra très bien se terminer sur une deuxième zone différente si l´adversaire y est ejecté. Les environnements seront interactifs. Le jeu aura également le droit au même type de mini-jeu adaptés à la manette Wii comme le jeu japonais Naruto Shippūden: Gekitō Ninja Taisen! EX en a eu le droit (ces mini-jeux portent les noms de Shuriken Throw, Rasengan Training et Shadow Clone Trick).
