"je voullais savoir si ça avait une influence sur mon os ou si ça allait l'éffacer"
Depuis quand un logiciel efface un OS ? Non ça ne va rien lui faire, ça va nettoyer tout ce qui est inutile sur ton ordi comme les cookies etc...
"je voulais savoir si je restaure le système ou je formate je vais perdre l'os ou pas ainsi que des logiciels importants comme msn, formatfactory, bittorrent ?"
Non, le principe d'un restore system est de revenir en arrière, à une date antérieure, ici tu devrais revenir jusqu'à 3-4 jours en arrière, soit avant que ton ordi bug.
Tu as eu le bon réflexe en sauvegardant les fichiers important sur un DD externe 
Donc fais un restore system maintenant, si après ça bug encore, il te reste le formatage comme solution radicale, mais tu veiller à disposer du CD de l'OS avant
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Croire est une chose, savoir en est une autre.
http://www.youtube.com/watch?v=_CBTZqO83WQ
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