La 9800GTX fait la taille de la 8800GTX il me semble. Si c'est le cas, alors pour la faire rentrer dans le Sonata il faut sacrifier un ventilo. 
C'est vrai que c'est dommage que le Sonata III ne soit pas super spacieux, car à part ça c'est un bon boitier pour son prix.
Comme alternative y a bien le Cooler Master RC-690.