honnetement un petit 4200+ x2 en 939 te mettrais à l´abri pendant un bon bout de temps, le problème c´est que tu sois en AGP, ce qui fait que le changement de CG imposerait le changement de carte mère, de proco et de ram, ce qui risque de poser problème vu que la 6800 n´est plus toute jeune, à mon avis tu devrais garder ton 3200 et tout changer plus tard.
pour répondre à ta question, vista n´a pas d´importance, fait ta config quand bon te semble