oui tu peux sans problème,les prises molex 4 broches ont en fait 2 circuits,1 en 5 volts (rouge et noir) et un autre en 12 (jaune et noir),relies là ou il faut.
Sinon,tu peux juste y coller un petit potentiomètre comme celui la
http://www.materiel.net/details_FANMATE.html
en vente chez ton revendeur je suppose