Si ça vient du HDD tu entend le bruit assez regulierement au demarrage et apres ça se calme un peu...
Tout tes ventilo sont bien fixés ?
Tu a verifier celui de l´alim ?
Regarde aussi que tu n´ai pas un ventilo qui souffle directement sur une piece mal fixé(un cable par exemple).
Pour le HDD verifie que le S.M.A.R.T. est bien activé dans le BIOS,s´il y a un probleme de lancement du plateau ou des têtes,ça devrait te mettre un petit message au boot 