mettre le rad en externe a deux avantage,un il ne prend pas de place dans la tour, tu peux te permettre de lui faire une " jupe" ( ecarter les ventilo du rad pour plus de perf)
CF ces topics:
http://www.nokytech.net/forum/showthread.php?s=&threadid=9285
http://www.nokytech.net/forum/showthread.php?s=&threadid=4978
Ce site:
http://www.overclockers.com/tips1022/
Ne serait-ce que pour comprendre le principe.
Inconveignant du rad externe:
C´est le gros bordel pour bouger le tout en LAN 
C´est moins beau a mon gout(ça c´est perso).
Pour ce qui est de l´ordre dans le circuit,ça n´a pas grande importance en fait.On a longtemps cru qu´il fallait mettre le radiateur juste avant la pompe pour qu´elle ne prenne pas trop la chaleur,puis certains ont pensé que mettre le radiateur juste avant le WB CPU etait mieux parce que c´etait plus froid...En fait on se rend compte que la difference maximal entre tous les points d´un circuit est de a peine 0.5 °C,maximum 1°C donc tu mets les composants dans l´ordre que tu veux.
regarde quand même quel est l´ordre le plus pratique pour avaoir accés a tout ce qu´il faut.Faut que tu puisse vider l´eau en cas de besoin(ou de probleme
ça m´est arrivé avant-hier
) et essais de limiter au maximum la longueur de tuyaux dans le circuit(pas la peine de faire 50 tours de tuyaux dans la tour,plus c´est droit,mieux c´est).