Il suffit de suivre ce tuto : http://www.commentcamarche.net/faq/21013-windows-creer-une-cle-usb-d-installation#methode-2-windows-sept-vista (méthode 2).
J'avais le même problème que toi, j'ai suivi le tuto, et aucun souci pour passer d'un W7 32 bits à 64 bits.