Lors de l'installation de Windows, tu pourras choisir la partition sur laquelle tu installes l'OS, tant que tu ne spécifie pas la suppression d'une partition, il ne le fera pas.
Par contre, dans le cas d'une réinstallation, je trouve qu'il vaut mieux formater la précédente partition système sous peine d'avoir entre autre 2 répertoires Windows.